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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

优势产业快速向新兴产业转型 河南洛阳推出一批先进制造业改造项目******

　　本报郑州12月18日讯（记者夏先清、杨子佩）今年以来，河南省洛阳市以推进制造业高端化、智能化、绿色化、服务化为发力点，陆续出台支持政策，推动传统优势产业向“风口”产业转型。据了解，今年以来，洛阳已推出制造业“三大改造”项目450个以上，年度投资350亿元以上。

　　近日，位于洛阳市伊滨区的中州时代新能源生产基地项目现场一片繁忙。作为洛阳正式“牵手”宁德时代协同推进新能源产业生态建设的重要载体，该项目将按照“灯塔工厂”标准建设，首期项目总投资约140亿元，预计3年内建成投产。

　　先进制造业集群是推动产业迈向全球价值链中高端的必然选择。在创新载体建设领域，洛阳在推动4家省级产业研究院和10家市级产业研究院建设的基础上，正加快实施一批科技攻关项目，突破一批关键核心技术，力争年内新增技术创新示范企业3家以上，培育各级质量标杆20家以上。

　　立足数字经济发展，洛阳将围绕大数据、“5G+工业互联网”领域，充分发挥中移在线、华为新基建发展中心、阿里云等资源优势，积极对接头部企业，加快建设中部云谷、5G无线网新建工程、中科人工智能数据生产交易中心等重点项目。

　　洛阳市市长徐衣显表示，洛阳加快落实产业发展工作举措，聚焦制造业高质量发展主攻方向，以发展风口产业为主线，培育发展光电元器件、农机装备、人工智能、新能源电池等十大产业集群，加快建设万亿元级全国重要的先进制造业基地。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）